Jan 052014
 

Samlingen af maskinen gik forholdsvist smertefrit, der medfølger en ganske god manual på en ca. 80 sider der beskriver samling og test af maskinen. Samling tog ca. 4 timer, hvilket stemmer overens med manualens bud.

Caveats

Følgende er mine erfaringer fra samling af maskinen.

  • Kassen er laserskåret i birketræsfiner. Bemærk der sidder et lag beskyttelsespapir på den ene side af træet der beskytter mod varmepåvirkning. Det kan ses på det første billed nedenfor. Fjern dette papir inden maskinen samles. Det sidder så godt fast at jeg overså det i første omgang og brugte en del tid på at skille huset ad og fjerne papiret bagefter!
  • Termosensoren i heatblokken har et hårfint, tyndt kabel. Pas godt på ikke at knække dette kabel under montagen.
  •  Det varmebeskyttende filt til heat blokken var ikke særlig præcist skåret ud! Hvis du har noget til overs selv eller kan skaffe noget i samme tykkelse vil jeg anbefale at lave det bedre selv. Det kan  have en effekt på varmeafgivelsen.
  • Software downloades fra http://openpcr.org/use-it (Fejl i manualen! Der står http://openpcr.org/start). Softwaret er testet og fungerede både til Windows og til Mac.

Heater lid

Låget indeholder et varmeelement der skulle kunne forhindre kondensation under brug. Varmeelementet virker, men jeg har ikke testet værdien af det, da jeg ikke har nogen eppendorf tubes jeg kan teste på endnu. Højden af varmelementet over heat blokken justeres med det sorte håndtag. Hvis varmeelementet ikke kører jævnt op og ned skyldes det sandsynligvis at en plastic spacer (afstandsskive) går imod en af de fjederbelastede skruer på indersiden.

pcr heater lid pcr heater lid - justeringsskrue

Køleunit

Køleunitten er ligetil. De fire fastgøringsarme har nogle plasticbeslag der skal fjernes. Dette ordnes nemt med en skævbider.

openPCR - køleunit

 

Heat blok

Varmen til blokken styres af et Peltierelement. Hele blokken er en sandwich af syv lag, der skal sættes sammen korrekt. Brug tid hér til at få sat det ordentlig sammen, da det ikke kan skilles let ad igen (de varmeoverførende Thermal pads vil så skulle udskiftes!).

openPCR - heatblok

 

Display

LCD skærmen monteres i hullet i toppladen. Sørg for at vende display og kabel korrekt.

openPCR - med display

 

Final assembly

PSU og Arduino monteres i bunden af kassen. Der er mange kabler at holde styr på, husk igen at passe på ikke at knække det tynde kabel fra sensoren! Med de leverede kabelholdere er det forholdsvist enkelt at styre alt, så airflow i kassen ikke hindres, og så kablerne sidder ordentlig fast.

openPCR - final assembly

 

Software download og test

Software downloades fra http://openpcr.org/use-it (Fejl i manualen! Der står http://openpcr.org/start). Softwaret er testet og fungerede både til Windows og til Mac. Af én eller anden grund får adobe AIR et suffix "dmg.mdlp" tilføjet ved download. Derfor starter filen fejlagtigt op i MATLAB på Mac! Ret suffix til .dmg og installationen kører som forventet.

Software openPCR indeholder et program til test af maskinen (A simple test). Programmet kører fint og viser at både heat lid og heat blok varmer / køler som det skal. Et enkelt minus ved softwaren er at det ikke er muligt at vise en temperaturprofil under/efter kørslen. Det kunne være nyttigt til dokumentation af forsøg..

 

openPCR - testet og færdig!

Next steps..

Hvad så nu? Jeg overvejer stadig hvilke fantastiske og spændende eksperimenter der skal udføres. Forslag modtages gerne.

Samtidig må jeg erkende at det er 20 år siden jeg sidst lavede laboratorieeksperimenter i biokemi, og jeg er sikker på udviklingen ikke har stået stille siden da! Så jeg er også på udkig efter nye manualer og protokoller for håndtering af DNA.

Sorry, the comment form is closed at this time.